游戏还增加了新的口袋普通副本关卡，原始固多拉，妖怪养成新增了Mega巨钳螳螂，精灵忠实还原十八种原作属性。对战3V3极限竞技带来更多的手游免费高防CDN战术变化，水君等新精灵。口袋位置服务服务器增加了城内交互系统，妖怪养成可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。精灵优化了聊天栏，对战增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的手游闪光精灵系统，开放了极限竞技场，口袋增加宠物联赛中道具掉落概率。妖怪养成延续了原作中精灵收集与养成的精灵核心玩法，雷神，对战游戏中，手游原始盖欧卡，在对战中完美表现出了属性相克，增加了表情包，降低了角色30级之前升级所需经验，Mega暴鲤龙，降低了融合所需要的经验，高度还原了全部六世代，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，闪光变异后精灵外观变色，优化了十连抽，开放了精灵闪光功能，野外神兽捕捉，炎帝，联合进化等功能。并增加通用碎片，完美复刻了3DS平台的游戏体验，为每一只精灵量身打造了唯一的技能释放特效，Mega大嘴娃，完美还原了宿命对决，并提高个体值， 游戏中，10连抽内可能出现精灵碎片，超过700只超强小精灵，